NVIDIA GPU量子化学ab initio计算性能与并行效率研究

• 作者: 何禹 王一波
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 工学
• 关键词: GPU Hartree-Fock从头计算 TeraChem
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 575-581
• 页数: 7页
• 分类号: TQ015.9|TP391.9
• 字数: 5348字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16866/j.com.app.chem201605013

摘要

选择Valinomycin,Bamase等8个化学、生命科学领域的典型大分子体系,基函数数目从1160至12716范围,用NVIDIA K80 GPU高性能工作站,测试和分析了基于GPU特性设计的TeraChem量子化学程序的Hartree-Fock ab initio计算性能、并行效率,并与GAMESS程序在CPU典型集群上的计算精度和效率进行对比.结果表明,TeraChem在单一K80 GPU工作站的计算速度是16节点四核CPU集群的2至17倍;当GPU计算核心数增加4倍,GPU平台计算性能还能有2.5倍增长;若正确控制计算过程参数,GPU与CPU平台计算结果的计算精度完全一致.TeraChem在K80 GPU上的卓越计算性能和表现,可让化学家在普通化学实验室而不是超级计算中心,完成大规模的非经验量子化学计算,挑战计算化学极限.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何禹		9	75	3.0	8.0
2	王一波	贵州大学网络与信息化管理中心	33	164	6.0	12.0