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摘要:
[目的]研究炎性环境下强直性脊柱炎(AS)患者间充质于细胞(MSC)中的全基因组表达谱基因的表达情况.[方法]首先从AS患者骨髓腔中分离培养MSC并利用流式技术鉴定细胞特定表型;然后利用TNF-α(10 ng/mL)和IFN-γ(10 ng/mL)刺激模拟炎症环境;接着分别提取不同条件刺激下AS患者和正常人MSC中RNA并进行RNA质控;然后行全基因组基因芯片分析,并应用GO分析法和KEGGPathway分析法分析其中的差异表达基因和寻找相关信号通路;最后利用qRT-PCR方法验证上述基因芯片中筛选出的关键差异表达基因真实性.[结果]全基因组基因芯片分析结果显示炎性模拟环境培养下AS-MSC中差异表达基因数量明显增加,GO分析结果显示这些差异表达基因中,56.1%与生物学活动相关,28.99%与分子功能相关,14.91%与细胞构成相关.Kegg-Pathway分析结果显示这些差异表达基因主要与TLR信号通路和MAPK信号通路这两条通路密切相关,其中TLR信号通路包含8个差异表达基因,MAPK信号通路包含14个差异表达基因.qRT-PCR验证结果显示基因表达与基因芯片结果符合.[结论]炎性模拟环境下,AS-MSC中的差异表达基因数量明显增加,并且这些差异表达基因主要以TLR信号通路和MAPK信号通路为主.
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文献信息
篇名 模拟炎性环境下强直性脊柱炎患者MSC的基因表达
来源期刊 中山大学学报(医学科学版) 学科 医学
关键词 强直性脊柱炎 间充质干细胞 全基因组表达谱芯片
年,卷(期) 2016,(6) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 845-851
页数 7页 分类号 R593
字数 4262字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 沈慧勇 中山大学孙逸仙纪念医院骨科 99 805 14.0 21.0
2 王鹏 中山大学孙逸仙纪念医院骨科 57 319 10.0 16.0
3 刘婷 中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科 45 149 7.0 9.0
4 李玉希 中山大学孙逸仙纪念医院骨科 7 37 3.0 6.0
5 谢中瑜 中山大学孙逸仙纪念医院骨科 2 2 1.0 1.0
6 李进腾 中山大学孙逸仙纪念医院骨科 2 2 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
强直性脊柱炎
间充质干细胞
全基因组表达谱芯片
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中山大学学报(医学科学版)
双月刊
1672-3554
44-1575/R
大16开
广州市中山二路74号
46-141
1980
chi
出版文献量(篇)
4645
总下载数(次)
6
总被引数(次)
30237
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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