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模拟炎性环境下强直性脊柱炎患者MSC的基因表达
模拟炎性环境下强直性脊柱炎患者MSC的基因表达
作者:
刘婷
李玉希
李进腾
沈慧勇
王鹏
谢中瑜
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
强直性脊柱炎
间充质干细胞
全基因组表达谱芯片
摘要:
[目的]研究炎性环境下强直性脊柱炎(AS)患者间充质于细胞(MSC)中的全基因组表达谱基因的表达情况.[方法]首先从AS患者骨髓腔中分离培养MSC并利用流式技术鉴定细胞特定表型;然后利用TNF-α(10 ng/mL)和IFN-γ(10 ng/mL)刺激模拟炎症环境;接着分别提取不同条件刺激下AS患者和正常人MSC中RNA并进行RNA质控;然后行全基因组基因芯片分析,并应用GO分析法和KEGGPathway分析法分析其中的差异表达基因和寻找相关信号通路;最后利用qRT-PCR方法验证上述基因芯片中筛选出的关键差异表达基因真实性.[结果]全基因组基因芯片分析结果显示炎性模拟环境培养下AS-MSC中差异表达基因数量明显增加,GO分析结果显示这些差异表达基因中,56.1%与生物学活动相关,28.99%与分子功能相关,14.91%与细胞构成相关.Kegg-Pathway分析结果显示这些差异表达基因主要与TLR信号通路和MAPK信号通路这两条通路密切相关,其中TLR信号通路包含8个差异表达基因,MAPK信号通路包含14个差异表达基因.qRT-PCR验证结果显示基因表达与基因芯片结果符合.[结论]炎性模拟环境下,AS-MSC中的差异表达基因数量明显增加,并且这些差异表达基因主要以TLR信号通路和MAPK信号通路为主.
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文献信息
篇名
模拟炎性环境下强直性脊柱炎患者MSC的基因表达
来源期刊
中山大学学报(医学科学版)
学科
医学
关键词
强直性脊柱炎
间充质干细胞
全基因组表达谱芯片
年,卷(期)
2016,(6)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
845-851
页数
7页
分类号
R593
字数
4262字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
沈慧勇
中山大学孙逸仙纪念医院骨科
99
805
14.0
21.0
2
王鹏
中山大学孙逸仙纪念医院骨科
57
319
10.0
16.0
3
刘婷
中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科
45
149
7.0
9.0
4
李玉希
中山大学孙逸仙纪念医院骨科
7
37
3.0
6.0
5
谢中瑜
中山大学孙逸仙纪念医院骨科
2
2
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1.0
6
李进腾
中山大学孙逸仙纪念医院骨科
2
2
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引证文献(0)
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间充质干细胞
全基因组表达谱芯片
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研究来源
研究分支
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主办单位:
中山大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-3554
CN:
44-1575/R
开本:
大16开
出版地:
广州市中山二路74号
邮发代号:
46-141
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
4645
总下载数(次)
6
总被引数(次)
30237
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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