亚洲副溶血弧菌临床菌株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型研究

• 作者: 刘俊含 卢昕 徐嘉良 杜小莉 阚飙
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 副溶血弧菌 基于碱基序列的多位点序列分型 基于肽链的多位点序列分型 克隆复合体
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 论 著
• 页码范围: 722-724,745
• 页数: 4页
• 分类号: R183.4
• 字数: 3036字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2016.09.007

摘要

目的：了解来自亚洲的副溶血弧菌临床菌株的群组结构和克隆复合体构成。方法在 pubMLST 公共数据中筛选具有完整 ST 型及 pST 型的来自亚洲的副溶血弧菌临床菌株数据，进行亚群分析和克隆复合体分析，并分别构建基于 ST 型和 pST 型的最小生成树。结果从数据库中共筛选到具有 ST 型及 pST 型的来自亚洲的副溶血弧菌临床菌株数据341条，共含有157个 ST 型，以 ST3型为最多。其中有214条菌株数据来自中国（包括港台地区），覆盖了133个 ST 型，其中仍以 ST3型为最多。利用 eBURST 软件对数据进行分析，共发现了17个组，94个单体。STRUCTURE 软件分析显示，来自亚洲的副溶血弧菌临床菌株的适宜亚群数为7，各亚群内的样品平均距离为0．9113。结论来自亚洲的副溶血弧菌临床菌株具有高度多态性，可细分为7个亚群，MLST 分型时以 ST3型为多，AA-MLST 分型时以 pST2型为主。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘俊含	北京医院老年医学部	11	80	6.0	8.0
2	徐嘉良	北京工商大学食品学院食品添加剂与配料北京高校工程研究中心	9	19	2.0	4.0