绿色杜氏藻类胡萝卜素异构酶（CRTISO）的基因生物信息学与转录差异研究

• 作者: 周丽亚 朱帅旗 王何瑜 龚一富
• 来源期刊: 生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 绿色杜氏藻 crtiso 生物信息学分析 类胡萝卜素
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 15-19
• 页数: 5页
• 分类号: Q558
• 字数: 4833字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1736.2016.06.015

摘要

类胡萝卜素异构酶（ Carotenoid isomerase ， CRTISO）是类胡萝卜素生物合成途径中催化番茄红素由顺式结构向反式结构转变的关键异构酶。利用转录组测序获得绿色杜氏藻crtiso cDNA全长序列，进行生物信息学分析，并研究乙酰水杨酸（ ASA）、花生四烯酸（ AA）处理绿色杜氏藻后该基因转录差异与类胡萝卜素含量变化情况。生物信息学结果表明：绿色杜氏藻crtiso cDNA全长1176 bp，开放阅读框（ ORF）长度为795 bp，编码264个氨基酸。该蛋白质的理论相对分子质量为29522.6，理论等电点（PI）为5.86，该蛋白为稳定蛋白与亲水性蛋白，无信号肽和跨膜区域，定位于细胞质基质。氨基酸序列同源性比对结果表明其与小球藻的类胡萝卜素异构酶同源性最高，达到78％。 RT-qPCR结果表明，AA、ASA诱导后，该基因表达量均呈现先升高后降低的趋势，且当AA、ASA质量浓度分别为62.5 mg／L、50 mg／L时表达量最高。类胡萝卜素含量大致呈现逐渐升高的趋势。当AA、ASA质量浓度分别为312.5 mg／L、100 mg／L时，类胡萝卜素含量达到最高。即该基因与类胡萝卜素含量呈一定相关性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龚一富	宁波大学海洋学院	54	342	11.0	16.0
2	朱帅旗	宁波大学海洋学院	17	79	4.0	8.0
3	王何瑜	宁波大学海洋学院	29	117	5.0	9.0
4	周丽亚	宁波大学海洋学院	2	2	1.0	1.0