绿色杜氏藻DvGGPS生物信息学及转录差异研究

• 作者: 严小军 刘浩 周静 朱帅旗 王何瑜 马颖瑞 龚一富
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 绿色杜氏藻 GGPS基因 生物信息学分析 类胡萝卜素
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 635-642
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.04.0635

摘要

香叶酰香叶酰焦磷酸合成酶(GGPS)能够催化焦磷酸异戊烯酯(IPP)与二甲基丙烯焦磷酸(DMAPP)反应形成二萜化合物通用前体香叶酰基香叶酰焦磷酸(GGPP).为深入了解GGPS蛋白在类胡萝卜素合成途径中的作用,通过Illumina HiSeqTM 2000高通量测序获得DvGGPS基因cDNA全长序列,对GGPS基因序列进行生物信息学分析,并研究花生四烯酸(AA)、乙酰水杨酸(ASA)和硫酸铈铵(ACS)对DvGGPS基因转录水平的影响及绿色杜氏藻类胡萝卜素含量变化.生物信息学分析结果表明,DvGGPS基因cDNA全长2 229 bp,舍1 041 bp开放阅读框,编码346个氨基酸.GGPS蛋白质序列理论等电点(pI)为5.82,相对分子质量为37.66 kDa,该蛋白为疏水性蛋白,无信号肽和跨膜区域.二级结构预测显示该蛋白分子中α-螺旋结构最多,占57.23％.同源比对结果表明,绿色杜氏藻GGPS蛋白与雨生红球藻亲缘关系最近.qRT-PCR结果表明,62.5 mg·L-1 AA、50 mg· L-1 ASA和0.8 mg·L-1ACS处理的DvGGPS基因转录水平达到最高,此时类胡萝卜紊含量也均有提高,说明绿色杜氏藻类胡萝卜素的生物学合成可能是通过诱导DvGGPS基因表达实现的,DvGGPS基因在类胡萝卜素生物合成中起关键作用.DvGGPS基因的克隆及表达调控研究为今后探明类胡萝卜素积累的分子机理提供了重要参考,也为进一步通过代谢工程手段提高绿色杜氏藻类胡萝卜素含量奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	严小军	宁波大学海洋学院	235	1827	21.0	28.0
2	龚一富	宁波大学海洋学院	54	342	11.0	16.0
3	朱帅旗	宁波大学海洋学院	17	79	4.0	8.0
4	刘浩	宁波大学海洋学院	9	46	3.0	6.0
5	王何瑜	宁波大学海洋学院	29	117	5.0	9.0
6	马颖瑞	宁波大学海洋学院	2	6	2.0	2.0
7	周静	宁波大学海洋学院	3	10	2.0	3.0