杨树AP2/ERF转录因子家族生物信息学分析

• 作者: 周博如 姚文静 姜廷波 王升级 赵金玲
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 杨树 AP2/ERF转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 页码范围: 21-29
• 页数: 9页
• 分类号: S792.11
• 语种: 中文

摘要

AP2/ERF基因家族是植物所特有的一类转录因子,该转录因子参与多种生物学过程,包括植物生长、花发育、果实发育、种子发育、损伤、病菌防御、高盐、干旱等环境胁迫响应等.从毛果杨基因组数据库中查找210个毛果杨AP2/ ERF家族基因,根据其编码氨基酸序列的相似性和AP2/ERF结构域的数量可分为4类,分别为AP2、ERF、DREB和RAV亚家族及其他(Potri.002G246100).利用生物信息学方法分析了毛果杨210条AP2,/ERF蛋白序列的系统发生、基因组定位、氨基酸组成、理化性质及二级和三级结构等.研究结果可为杨树AP2/ERF家族基因的功能分析提供参考依据.