谷子bZIP转录因子家族的全基因组鉴定与生物信息学分析

• 作者: 卢平 李雪垠 武强强 武懿茂
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 谷子 bZIP 转录因子 基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1361-1370,1430
• 页数: 11页
• 分类号: S515
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.09.01

摘要

谷子是我国重要的杂粮作物之一,其籽粒营养价值高、可药用,茎秆可以作为饲料.bZIP基因家族是植物中家族成员数量最多的转录因子家族之一,其调节包括病原防御、光反应和胁迫信号、种子成熟和花发育等过程.利用谷子的全基因组数据库,通过多种生物信息软件及在线网站对谷子bZIP转录因子家族进行全基因组鉴定,并分析其系统进化、基因结构、蛋白质理化性质、保守基序、启动子顺式作用元件和表达量情况.结果 表明,谷子bZIP转录因子家族共有85个基因;亲缘关系较近的谷子bZIP基因的基因结构较为相似;所有bZIP转录因子蛋白质都有模体motif1,motif1在蛋白质序列中最为保守,其中的碱性氨基酸R以及L最保守;bZIP转录因子家族基因的启动子顺式作用元件种类较多,包括ABRE、ARE、CAT-box、G-box等元件,其参与调控胁迫响应、生长发育等过程.基因表达分析结果表明,亲缘关系较近的家族成员具有相似的表达特异性,Sib ZIP转录因子在根、花和叶片中均有成员表达;Sib ZIP11、Sib ZIP12和Sib ZIP72等在干旱处理的根中表达量较高.谷子bZIP转录因子家族分析结果可为进一步研究谷子bZIP基因功能和分子机制奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	武懿茂		6	5	1.0	2.0
2	李雪垠		5	1	1.0	1.0
3	卢平		1	0	0.0	0.0
4	武强强		3	1	1.0	1.0