谷子HSF转录因子基因鉴定与生物信息学分析

• 作者: 张凤洁 李雪垠 武懿茂 王兴春 韩渊怀
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 谷子 热激 转录因子 HSF 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传改良与栽培
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: S330
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201901045

摘要

[目的]谷子是我国北方重要杂粮作物之一,具有丰富营养和药用价值.谷子耐旱、耐贫瘠,生长周期内经常会面临干热风等不良自然环境.热激转录因子(heat shock transcription factor,HSF)是植物一类重要转录因子,通过和热激反应相关基因启动子顺式作用元件结合,精确调控下游基因时空表达,调节植物热激应答.本研究旨在鉴定并分析谷子热激转录因子家族基因.[方法]采用生物信息学方法,在全基因组水平上鉴定谷子HSF转录因子家族成员,并进行系统发育、基因结构、蛋白质模体、启动子顺式作用元件和基因表达分析.[结果]谷子HSF转录因子家族共有27个基因;亲缘关系较近的谷子HSF基因的基因结构和蛋白质氨基酸序列也较为相似;谷子绝大多数HSF基因只含有2个外显子,绝大多数内含子的相位是0;谷子所有HSF基因都含有motif1、motif2和motif3,这3个motif在谷子HSF蛋白质序列最为保守;SiHSF20等基因启动子区域都含有ABRE、MBS、TC-rich repeats等逆境胁迫响应元件;SiHSF1、SiHSF2和SiHSF3基因在干旱处理根组织中表达量都较高,说明这3个基因与干旱诱导表达相关.[结论]SiHSF1、SiHSF2、SiHSF3和SiHSF20基因可能参与调控谷子热激应答反应.谷子HSF基因家族分析有助于进一步鉴定热激应答相关基因,为挖掘抗逆基因资源提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王兴春	山西农业大学生命科学学院	28	656	6.0	25.0
2	韩渊怀	山西农业大学农学院	31	68	4.0	8.0
3	武懿茂	山西农业大学农学院	6	5	1.0	2.0
4	李雪垠	山西农业大学生命科学学院	5	1	1.0	1.0
5	张凤洁	山西农业大学农学院	9	22	3.0	4.0