番茄热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及表达分析

• 作者: 张海利 王燕 陈勇兵
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 热胁迫 热激转录因子(Hsf) 生物信息学 系统发育关系
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 492-501
• 页数: 10页
• 字数: 5494字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.04.008

摘要

热激转录因子(heat shock transcription factor,Hsf)已经被证实是广泛地存在于植物细胞内的一类重要的转录调节基因,对植物抵抗高温逆境伤害和其他生命活动具有重要作用.本研究利用番茄(ycopersicon esculentum)全基因组测序结果,鉴定番茄Hsf家族成员;通过生物信息学方法,分析其系统发育关系和染色体定位;利用已有的番茄芯片数据和qRT-PCR进行组织表达谱和基因表达响应分析.结果表明,番茄基因组含有25个Hsf基因家族成员,序列比对揭示其均具有转录因子特有的DNA结合域(DNA binding domain,DBD);根据拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)和黄瓜(Cucumis sativusL.)Hsf的基因结构和系统发育树将这些转录因子分为3个分支(A、B和C),细分为15个亚分支(A1～A9、B1～B4以及C1～C2).染色体定位结果表明,25个Hsy基因除Chr.1和Chr.5外,其余不均匀分布在剩余10条染色体上.各个发育阶段表达谱分析表明,Hsy基因具有不同的表达模式,近一半的基因处于高表达水平.qRT-PCR分析表明,大多数Hsf家族成员参与番茄苗期应对高温热激反应.研究结果为揭示番茄Hsf基因的功能提供基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈勇兵	温州科技职业学院浙南作物遗传育种重点实验室	32	62	4.0	6.0
2	张海利	温州科技职业学院浙南作物遗传育种重点实验室	32	57	4.0	6.0
3	王燕	温州科技职业学院浙南作物遗传育种重点实验室	15	61	4.0	7.0