象草全基因组bHLH转录因子家族鉴定及表达分析

• 作者: 高莉娟 张正社 文裕 宗西方 闫启 卢丽燕 易显凤 张吉宇
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 象草 bHLH转录因子 基因鉴定 表达分析
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 47-59
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10. 11686/cyxb2020593

摘要

bHLH转录因子家族不仅参与了植物的生长发育，而且在植物响应逆境胁迫和次生代谢方面发挥着关键作用。在全基因组水平对重要饲草及能源植物象草的bHLH转录因子家族进行了鉴定及分析，并利用转录组数据及定量RT-PCR分析了象草bHLH转录因子对赤霉素(GA3)和多效唑(PAC)的响应。结果显示:在象草中共鉴定出229个具有完整保守结构域的bHLH基因家族成员(CpbHLH001~CpbHLH229)，不均匀地分布于14条染色体上；系统进化分析结果表明，229个CpbHLHs可被分为18个亚类，其中C亚类的成员数量最多，为41个；此外，相同亚家族中的大多数基因具有相似的基因结构和保守基序；基于转录组数据的表达谱分析结果发现，多数bHLH基因在象草茎尖组织中均对GA3和PAC有响应。随机挑选9个表达量较高的基因进一步通过qPCR进行验证。结果显示，经外源GA3和PAC处理之后，这9个基因因不同处理而差异表达，表明这9个基因可能与GA3和PAC介导的信号通路有关。综上所述，本研究为象草bHLH转录因子家族的生物学功能奠定了基础。