辣椒R2R3-MYB转录因子家族的全基因组鉴定与比较进化分析

• 作者: 康凯程 牛西强 黄先忠 胡能兵 隋益虎 张开京 艾昊
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: 一年生辣椒 浆果状辣椒 中国辣椒 R2R3-MYB转录因子 直系同源基因
• 年，卷（期）: 2021,（null）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 315-329
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB20143

摘要

MYB转录因子作为植物中最大的转录因子家族之一，参与植物的生长、代谢、抵御生物和非生物胁迫等多种生理生化过程。R2R3-MYB是MYB转录因子家族的主要存在形式。辣椒是具有重要经济价值的蔬菜作物，其R2R3-MYB转录因子缺乏系统的研究。从一年生辣椒(Capsicum annuum)、浆果状辣椒(C. baccatum)和中国辣椒(C. chinense)基因组中分别鉴定出94、92和94个R2R3-MYB基因，基于系统发育关系将其分为28个亚族。共线性分析表明，3种辣椒间存在73组直系同源R2R3-MYB基因，一年生辣椒、浆果状辣椒和中国辣椒分别存在5、4和2个特有的R2R3-MYB基因。鉴定出12对重复基因，其中8对是串联重复基因，它们在3种辣椒分化前就已经存在。比较基因组学分析表明，在辣椒进化过程中同源R2R3-MYB转录因子发生了功能分化。组织表达分析表明，辣椒R2R3-MYB基因主要有3种表达特征: 在根、叶、茎和花中均高表达，如CaMYB13/CbMYB12/CcMYB13；仅在花中高表达，如CaMYB93/CbMYB86/CcMYB12；仅在根中高表达，如CaMYB48/CbMYB47/CcMYB51。研究结果为深入揭示R2R3-MYB转录因子在辣椒生长发育中的生物学功能奠定了基础。