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小麦B-box基因家族全基因组鉴定与表达分析
小麦B-box基因家族全基因组鉴定与表达分析
作者:
王艳朋
凌磊
张文睿
王丹
郭长虹
原文服务方:
作物学报
小麦
全基因组
B-box基因家族
非生物胁迫
基因表达
摘要:
B-box (BBX)是一类含有1个或2个B-box结构域的锌指蛋白, 在植物生长发育中起着重要作用。本研究明确小麦B-box转录因子的数量、基因结构和分类进化关系, 研究各基因成员在不同组织中的特异性表达以及对非生物胁迫的响应。从小麦全基因组中鉴定得到87个B-box基因家族成员, 所有TaBBXs蛋白均含有B-box结构域。TaBBXs编码146~489个氨基酸, 理论等电点为4.32~10.42。染色体定位分析表明, TaBBXs分布在除1A、1B和1D之外的18条小麦染色体上。通过系统发育分析将TaBBXs划分为5个亚家族, 有0~4个内含子。在同组内同一个系统进化树分支中的亚族成员具有高度相似的基因结构。qRT-PCR分析的20个TaBBXs基因, 具有不同的组织表达模式, 16个基因在叶中有较高表达, TaBBX10和TaBBX39仅在叶中有较高表达, 而TaBBX74在穗中表达, TaBBX43在根中特异性表达。在不同逆境胁迫下, TaBBXs呈现不同表达模式, 11个基因在低温胁迫后上调表达, 12个基因在ABA处理后下调表达, 盐胁迫后10个基因出现上调表达, 干旱胁迫后7个基因出现下调表达, TaBBX10、TaBBX39、TaBBX60、TaBBX67和TaBBX74基因在2种或2种以上胁迫下有显著的上调表达。
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文献信息
篇名
小麦B-box基因家族全基因组鉴定与表达分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
小麦
全基因组
B-box基因家族
非生物胁迫
基因表达
年,卷(期)
2021,(8)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
1437-1449
页数
12页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2021.01077
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
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2021(0)
参考文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
小麦
全基因组
B-box基因家族
非生物胁迫
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
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