马铃薯GAUT基因家族的全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 牛娜 刘震 黄鹏翔 朱金勇 李志涛 马文婧 张俊莲 白江平 刘玉汇
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 马铃薯 半乳糖醛酸转移酶 表达分析 花色素苷生物合成
• 年，卷（期）: 2021,（12）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 2348-2361
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2021.04268

摘要

半乳糖醛酸转移酶(GAUT)是一种参与催化糖基化反应的酶类，在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究鉴定了马铃薯GAUT家族成员，并对其理化性质、染色体定位、基因结构、保守蛋白结构域、基因重复事件和表达模式进行了分析。结果表明，鉴定到的41个GAUT家族成员(StGAUT)，不均匀的分布在10条染色体上。根据基因的结构和系统发育蛋白特征，将41个StGAUT分为4个亚组。共线性分析表明，StGAUT基因家族存在12对片段重复基因，均在纯化选择下进化。通过对马铃薯双单倍体(DM)的不同组织部位和非生物胁迫下的RNA-seq数据进行分析，筛选出了组织特异性表达及响应非生物胁迫的StGAUT基因。此外，进一步对不同四倍体栽培种彩色马铃薯的薯皮和薯肉进行RNA-seq测序和分析，获得了可能参与花色素苷生物合成的StGAUT基因。本研究结果为进一步阐明StGAUT基因在马铃薯中的功能提供了有价值的信息。