藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析

• 作者: 时丕彪 何冰 费月跃 王军 王伟义 魏福友 吕远大 顾闽峰
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 藜麦 GRF转录因子 进化分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1841-1850
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.94049

摘要

生长调控因子(growth-regulating factor, GRF)是植物特有的一类转录因子，对植物的生长发育起重要的调控作用。藜麦是一种单体植物即可满足人体基本营养需求的食物，也是未来最具潜力的农作物之一。但是关于藜麦GRF基因家族的研究至今尚缺乏报道。因此，本研究利用生物信息学方法，对藜麦GRF基因进行全基因组鉴定，并对其理化性质、基因结构、保守结构域、系统发育关系及组织表达进行分析。结果表明，藜麦中共有18个GRF转录因子，蛋白长度77~621aa，分子量8.81~67.38kD，等电点5.23~9.37;每个成员含有1~4个内含子及2~5个外显子，这些GRF蛋白都具有由31~35个氨基酸组成的QLQ保守结构域或由25~43个氨基酸组成的WRC保守结构域。系统进化分析表明，藜麦与拟南芥的GRF转录因子亲缘关系比水稻更近。表达图谱显示，藜麦GRF基因具有明显的组织表达特异性，总体在种子中的表达量较高，其次是在花序和根中，在其他组织中的表达量相对较低。