人类PPARγ基因5'-非翻译区转录调控序列生物信息学分析

• 作者: 林绍鹏 魏伟民
• 来源期刊: 山西中医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 PPARγ 启动子 转录调控
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 现代生物医学
• 页码范围: 56-58
• 页数: 3页
• 分类号: R346
• 字数: 2110字
• 语种: 中文

摘要

目的:对人类PPARγ基因5'-非翻译区进行生物信息学的分析.方法:通过搜索网络数据库,得到PPARγ基因翻译起始点上游约2 kb的序列.运用PROMOTER SCAN分析该序列可能的启动子区域,利用在线分析软件EMBOSS、MethPrimer和CpG Island Searcher分析该序列潜在的CpG岛,运用TFSEARCH软件分析该序列潜在的转录因子结合位点.结果:人类PPARγ基因5'-非翻译区转录起始位点上游反向链2 425到2 175区具有启动子活性,在启动子上具有TATA盒.PPARγ基因5'-非翻译区转录起始位点上游2 kb序列存在包括MyoD、HSF和Nkx-2等19个转录因子的潜在结合位点,不存在CpG岛.结论:该实验为后续的PPARγ基因的转录调控研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林绍鹏	广州医科大学第二附属医院急诊科	16	94	6.0	9.0