牛Meg8基因5'末端的克隆及生物信息学分析

• 作者: 侯晓慧 李世杰 苏红
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 牛 Meg8基因 5'RACE 可变剪接 启动子 转录因子结合位点
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 81-86
• 分类号: Q341
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1573.2011.04.016

摘要

利用RACE方法从奶牛中克隆得到了Meg8基因的5 '端cDNA序列(GenBank登录号:HQ407410～HQ407413),序列比对发现该基因存在4种可变剪接体.选取牛Meg8基因的5'侧翼区作为研究对象,生物信息学在线分析发现:在人、绵羊、鼠、猪、狗和马这几个物种中,牛Meg8基因5'侧翼区与绵羊相似性最高,为80.45%；该区域内存在2个SINEs、1个Simple repeat,未发现CpG岛；可能存在2个启动子位点,位于牛Meg8基因的Exon1前3 402～4 118 bp和1 200～1 367 bp处,并富含Sp1、SRY、CdxA、GATA-1、MZF1等多个潜在的转录因子位点.Meg8基因5'侧翼区密集存在的转录因子可能与基因的转录起始有关.可变剪接体及侧翼区域的诸多转录因子可能是Meg8基因行使调控功能的原因,本研究结果将为阐明该基因的功能及其调控机理提供分子基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李世杰	河北农业大学生命科学学院	36	214	7.0	13.0
2	苏红	河北农业大学生命科学学院	15	40	4.0	5.0
3	侯晓慧	河北农业大学生命科学学院	2	7	2.0	2.0