星豹蛛CYP3313A3基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 任彦鸿 李锐 燕晶晶 王雅丽 田国强 赵瑞
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 星豹蛛 细胞色素P450 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 59-65
• 页数: 7页
• 分类号: S220.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842/j.cnki.issn1671-8151.202001018

摘要

[目的]星豹蛛是农业害虫的重要捕食性天敌,本课题组通过转录组测序鉴定出66条星豹蛛细胞色素P450基因,筛选分析出5条基因预测其与外源物质代谢有关,选取其中一条基因进行克隆并进行生物信息学分析.[方法]本试验采用RT-PCR技术,将提取的星豹蛛总RNA进行反转录PCR扩增,用割胶回收的扩增产物完成克隆及测序,并对CYP3313A3基因编码产物进行生物信息学分析.[结果]克隆到CYP3313A3基因序列,该基因开放阅读框为906 bp,编码301个氨基酸,其相对分子质量为34.38 kDa,等电点6.12,原子总数4865,分子式C1546H2451N403O449S16;其中正电荷残基36个,占氨基酸总数的12％,负电荷残基39个,占氨基酸总数的13％,编码蛋白存在细胞色素P4503A亚族特征基序,其编码的蛋白的二级结构中,α螺旋为45.18％,β折叠为14.29％,β转角为3.32％,无规则卷曲为37.21％,亚细胞定位结果显示在内质网上.对其编码的蛋白进行信号肽预测结果显示,该蛋白存在信号肽;对该蛋白的跨膜结构预测分析,结果显示该蛋白不存在跨膜结构.[结论]获得的CYP3313A3基因属于CYP3家族,本研究对今后星豹蛛细胞色素P450基因的研究提供了研究基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李锐	山西农业大学农学院	52	265	9.0	12.0
2	任彦鸿	山西农业大学农学院	3	0	0.0	0.0
3	王雅丽	山西农业大学农学院	2	0	0.0	0.0
4	赵瑞	山西农业大学农学院	3	4	1.0	2.0
5	燕晶晶	山西农业大学农学院	3	0	0.0	0.0
6	田国强	山西农业大学农学院	3	0	0.0	0.0