星豹蛛细胞色素CYP3001U15基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 任彦鸿 李锐 燕晶晶 王雅丽 田国强 赵瑞
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 星豹蛛 细胞色素P450 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 842-846
• 页数: 5页
• 分类号: Q813.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.06.03

摘要

星豹蛛是农业害虫的重要捕食性天敌.通过转录组测序鉴定出66条星豹蛛细胞色素P450基因,进一步筛选分析出5条基因,预测其与外源物质代谢有关.为进一步研究星豹蛛细胞色素P450功能和代谢机制,选取其中一条基因进行生物信息学研究.试验通过RT-PCR扩增技术,将星豹蛛总RNA反转录cDNA,后以此为模板进行PCR扩增,回收纯化产物完成单克隆并测序,获取该基因序列信息,并对其进行生物信息学分析.结果发现,克隆到CYP3001U15基因ORF序列,该基因开放阅读框为1074 bp,编码357个氨基酸,分子质量为42 ku,等电点为5.91,原子总数为5808,分子式为C1877H2896N494O531S10;正电荷残基47个,占氨基酸总数的13.2％,负电荷残基52个,占氨基酸总数的14.6％;蛋白的二级结构预测结果显示,α螺旋占47.62％,β折叠占8.96％,β转角占4.76％,无规则卷曲占38.66％;亚细胞定位预测结果显示,其定位在细胞内质网上;蛋白信号肽预测结果显示,该蛋白不存在信号肽;跨膜结构预测分析结果显示,其不存在跨膜结构.研究结果可就星豹蛛细胞色素P450基因对杀虫剂等外源物代谢的研究提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李锐	山西农业大学农学院	52	265	9.0	12.0
2	任彦鸿	山西农业大学农学院	3	0	0.0	0.0
3	王雅丽	山西农业大学农学院	2	0	0.0	0.0
4	赵瑞	山西农业大学农学院	3	4	1.0	2.0
5	燕晶晶	山西农业大学农学院	3	0	0.0	0.0
6	田国强	山西农业大学农学院	3	0	0.0	0.0