烟草CYP71D亚家族的生物信息学分析

• 作者: 王蕾 赵泽玉 陈明丽 龚达平
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 烟草 CYP71D亚家族 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 79-85,92
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2020.02.014

摘要

细胞色素P450(CYP450)是一类超基因家族编码的多功能氧化酶,在生物合成、代谢解毒及植物防御方面具有重要作用.其中CYP71D属于CYP450的一个亚家族,主要在次生代谢物合成和病虫害防御方面起作用.为了更好地了解烟草CYP71D亚家族基因特征和功能,本研究利用生物信息学分析手段及烟草转录组数据,对CYP71D亚家族基因的结构和表达等进行了分析.结果发现,在烟草中共有42个CYP71D亚家族成员,各成员在染色体上并非均匀分布,其氨基酸长度和等电点差异较大,但基因结构、保守结构域数目和分布高度一致;二级结构分析表明,烟草CYP71D亚家族成员具备P450蛋白特征结构域;基因表达模式分析显示,多数CYP71D基因在根、叶、花中特异表达,大部分基因参与了IAA激素、黑胫病、温度等逆境胁迫反应.这为烟草CYP71D亚家族基因功能的深入研究及烟草抗逆品种的培育奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王蕾	中国农业科学院烟草研究所	33	235	9.0	13.0
5	陈明丽	中国农业科学院烟草研究所	7	26	3.0	5.0
6	龚达平	中国农业科学院烟草研究所	13	44	3.0	6.0
7	赵泽玉	中国农业科学院烟草研究所	1	0	0.0	0.0