玉米JAZ基因家族的生物信息学分析

• 作者: 任永康 刘江 唐朝晖 牛瑜琦 王长彪 赵兴华 韩斌
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 玉米 JAZ基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1552-1556
• 页数: 5页
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.10.02

摘要

基于已发布的玉米全基因组数据,利用系列生物信息学分析软件对玉米JAZ基因家族进行了氨基酸组成及其理化性质、蛋白质亲疏水性、磷酸化位点、二级结构元件和含量、跨膜结构域、信号肽、蛋白质亚细胞定位、功能结构域预测和分析.结果 表明,玉米JAZ蛋白的氨基酸残基数目介于110～ 426个,相对分子质量介于11 834.49 ～ 30 494.24,理论等电点介于4.89 ～ 10.18,玉米JAZ蛋白的主要氨基酸为丙氨酸、脯氨酸、精氨酸等.稳定性预测结果表明,玉米JAZ蛋白均为非稳定性蛋白质;信号肽和跨膜结构域预测结果显示,这些蛋白质均为非分泌蛋白质,不具有信号肽,且没有明显的跨膜结构域.JAZ蛋白二级结构元件主要为不规则卷曲、α-螺旋和延伸链.亚细胞定位预测结果显示,JAZ蛋白质主要定位于细胞核;结构域预测结果表明,JAZ蛋白均含有JAZ蛋白家族典型的TIFY和CCT-2功能结构域.研究结果可为玉米JAZ基因功能研究和玉米性状定向改良奠定理论基础.