普通烟草碳酸酐酶家族基因的生物信息学分析

• 作者: 吕承承 吴润生 曾鼎宸 李立芹 童铸 蒋垚 赵希胜 鲁黎明
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 烟草 碳酸酐酶 生物信息学 基因结构 表达
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 68-76
• 页数: 9页
• 分类号: S572.03
• 语种: 中文
• DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2019.05.010

摘要

为挖掘普通烟草碳酸酐酶基因的信息并探讨其功能,本研究利用生物信息学方法,在烟草基因组数据库中对普通烟草碳酸酐酶家族成员进行了检索,并对其理化性质、遗传进化、基因结构、蛋白保守基序、顺式作用元件和组织表达模式进行了分析.结果显示,在普通烟草中至少含有9个α和6个β亚家族成员.在进化关系上,不同亚家族成员之间,序列同源性较低;与水稻相比,拟南芥和普通烟草两个亚家族间的亲缘关系较近.亚细胞定位分析结果显示,烟草α亚家族成员在细胞壁、细胞膜、线粒体、叶绿体、细胞质等细胞器中均有分布,而β亚家族成员均存在于叶绿体中.基因结构和保守基序分析说明,各亚家族成员的基因结构和蛋白保守基序呈现较高的一致性.启动子顺式作用元件分析显示,烟草碳酸酐酶基因的启动子中,均含有多个参与光反应、激素响应、非生物胁迫和机械损伤等相关的顺式作用元件.基因组织表达模式分析表明,烟草的碳酸酐酶基因不同成员在不同组织表达水平存在差异,并呈现出时空特异性.本研究结果为烟草碳酸酐酶基因的功能研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李立芹	四川农业大学农学院	48	298	10.0	13.0
2	鲁黎明	四川农业大学农学院	60	354	11.0	15.0
3	蒋垚	四川农业大学农学院	5	0	0.0	0.0
4	童铸	四川农业大学农学院	3	0	0.0	0.0
5	赵希胜	四川农业大学农学院	4	0	0.0	0.0
6	曾鼎宸	四川农业大学农学院	2	0	0.0	0.0
7	吕承承	四川农业大学农学院	1	0	0.0	0.0
8	吴润生	四川农业大学农学院	1	0	0.0	0.0