谷子NRT2基因家族的鉴定及生物信息学分析

• 作者: 叶玲 张洁 王兴春 赵雄伟 郭永正
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 谷子 硝酸盐 硝酸盐转运蛋白2 表达谱
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 283-290
• 页数: 8页
• 分类号: S515
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.03.02

摘要

硝态氮是旱地植物吸收氮素的主要形式,其吸收与硝酸盐转运蛋白2(NRT2)有重要的关系.谷子作为耐贫瘠作物,对土壤中的氮素吸收和利用效率较高.研究以谷子xiaomi为参考基因组,利用生物信息学方法鉴定了谷子NRT2基因家族成员,并分析其基因结构、理化性质、二级结构、启动子区顺式作用元件和表达谱.结果表明,在谷子全基因组水平上共鉴定到8个NRT2基因,其分布在1号(6个NRT2)和5号(2个NRT2)染色体上,均由α-螺旋、β-折叠、直链延伸和无规卷曲组成,其中,有6个NRT2基因的启动子区均具有数个植物激素和逆境应答元件.亚细胞定位结果表明,8个NRT2基因均在质膜上行使功能.基因表达模式分析结果显示,Si5g20720主要在叶片和茎秆中表达,Si5g29250主要在根系和茎秆中表达,而其他谷子NRT2基因在整个生长发育过程中表达量都很低或没有表达;在低氮胁迫下,Si5g29250基因的表达量显著上调.生物信息学分析结果表明,Si5g29250可能在参与谷子硝酸盐吸收转运的过程中发挥重要作用.该研究结果可为进一步分析谷子吸收和转运硝酸盐的关键NRT2家族基因的克隆及功能研究提供一定的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王兴春	山西农业大学生命科学学院	28	656	6.0	25.0
2	张洁	山西农业大学文理学院	16	51	4.0	7.0
3	赵雄伟	山西农业大学生命科学学院	5	0	0.0	0.0
4	叶玲	山西农业大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
5	郭永正	山西农业大学文理学院	3	1	1.0	1.0