牛PEG11基因生物信息学分析

• 作者: 张坤 李世杰 李冬杰 石运娇 苏红
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 牛 PEG11基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 页码范围: 95-99
• 页数: 5页
• 分类号: Q38|Q341
• 语种: 中文

摘要

采用生物信息学方法对牛PEG11基因进行分析,为进一步揭示该基因生物学功能和其分子调控机理奠定基础.选取6种哺乳动物PEG11基因的CDS序列作为研究对象,进化分析表明:包括牛、羊、小鼠、熊猫、猪和人在内的6种哺乳动物间的遗传距离小于0.109,且牛与猪遗传距离最小,为0.036,与基因进化树分析结果一致.CpG岛在线软件预测显示,在牛中该基因上游5 kb内没有CpG岛.启动子在线软件预测和转录因子分析相结合显示,启动子可能位于该基因5 '端上游2 181～2 131 bp处,此区域包括大量潜在转录因子结合位点,并在2 173 bp处存在一个TATA框.蛋白质在线软件分析表明,PEG11基因编码一种螺旋形跨膜蛋白质,有α-螺旋、8-转角和自由卷曲3种二级结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李冬杰	河北科技大学生物科学与工程学院	49	432	11.0	19.0
2	李世杰	河北农业大学生命科学学院	36	214	7.0	13.0
3	苏红	中国地质大学长城学院	12	20	2.0	4.0
4	石运娇	河北农业大学生命科学学院	2	4	2.0	2.0
5	张坤	河北农业大学生命科学学院	2	4	2.0	2.0