鳗草HSF基因家族的筛选与生物信息学分析

• 作者: 唐学玺 尚帅 臧宇 薛颂 陈军
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 鳗草 全基因组 热激转录因子 基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 海洋生态环境
• 页码范围: 10-19
• 页数: 10页
• 分类号: Q74
• 字数: 5244字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20200149

摘要

鳗草(Zostera marina)作为适应在海洋环境中生长和繁殖的多年生被子植物,是研究海洋高等植物分子进化的理想物种.热激转录因子(HSF)在植物细胞的修复、蛋白的转录修饰以及信号转导中具有重要的作用.为全面了解鳗草基因组中HSF基因家族信息,本文采用生物信息学手段,在鳗草基因组中鉴定了11个ZmHSFs基因,基因长度差异较大,但均不含有内含子.系统发育结果显示11个基因分为HSFA和HSFB两大分支.顺式作用元件分析表明ZmHSFs基因很可能同时受到温度和光照等多种非生物因素的调节.此外,鳗草HSF基因家族数目明显小于其他高等植物,二次入海过程可能导致部分ZmHSFs基因丢失.转录组数据表明HSF基因在3种不同器官中均有表达,且存在一定的器官表达差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐学玺	中国海洋大学海洋生命学院	177	2051	23.0	31.0
2	陈军	中国海洋大学海洋生命学院	8	85	3.0	8.0
3	尚帅	中国海洋大学海洋生命学院	1	0	0.0	0.0
7	薛颂	中国海洋大学海洋生命学院	1	0	0.0	0.0