头颈鳞癌靶向放射治疗敏感性lncRNA的初步筛选

• 作者: 叶惠平 易烛光 龚正鹏
• 来源期刊: 贵阳医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: RNA,肿瘤 芯片 头颈部肿瘤 KEGG通路 放疗
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 206-208,212
• 页数: 4页
• 分类号: R73-36
• 字数: 2372字
• 语种: 中文

摘要

目的:初步探讨长链非编码RNA(lncRNA)在研究头颈鳞癌(HNSCC)放疗中的作用.方法:将HNSCC-SCCⅦ细胞分为对照组(不予放疗)和实验组(予放疗干预),应用芯片技术,筛选出放疗干预后HNSCC-SCCⅦ细胞中差异表达的lncRNA及mRNA,通过Cis和Trans法对靶基因进行预测,应用DAVID软件进行KEGG通路筛选,得到对应的靶基因富集的KEGG通路包括肿瘤相关通路、Wnt信号通路及轴突导向通路,分析这3条通路上对应的靶基因,并找到与这些靶基因对应的lncRNA.结果:筛选出1 280条放疗差异表达的lncRNA,对照组相对实验组高表达5倍以上的共15条,低表达5倍以上的共8条;筛选发现表达差异的mRNA有1 087条,对照组相对实验组高表达的528条,对照组相对实验组低表达559条;KEGG通路信息分析lncRNA对应的靶基因富集于肿瘤相关通路、Wnt信号通路和轴突导向通路;Wnt信号通路中靶基因PRKCA和STAT5B对应的lncRNA与mRNA是共表达的,对应的16203-3lncRNA在对照组的表达为实验组的3.176倍(P＜0.05),对应的31238-3lncRNA在实验组中的表达量为对照组中的2.037倍(P＜0.05).结论:PRKCA和STA T5B可能是控制HNSCC放疗反应敏感性的靶基因,对应的16203-3lncRNA和31238-3lncRNA可作为调控HNSCC放疗敏感性的候选lncRNA.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶惠平	贵州医科大学附属白云医院耳鼻咽喉科	11	5	1.0	1.0
5	易烛光	贵州省人民医院耳鼻咽喉科	3	2	1.0	1.0
6	龚正鹏	贵州医科大学附属白云医院耳鼻咽喉科	19	15	2.0	3.0