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摘要:
目的:采用生物信息学方法研究宫颈鳞状细胞癌(CESC)组织中差异性表达的miRNA并预测其靶基因,以期找到影响CESC发生发展及可用于肿瘤标志物的miRNA.方法:癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载3例CESC组织及3例配对正常组织,用统计学方法对差异性表达的基因及miRNA进行筛选,通过靶基因预测网站对差异性表达的miRNA进行靶基因预测,运用KEGG数据库分析靶基因参与的肿瘤相关信号通路.结果:与同源正常组织比较,CESC组织有18个miRNA和1 180个基因有差异性表达(P<0.05),其中有15个miRNA和411个基因上调,3个miRNA和770个基因下调,采用靶基因预测网站有7个miRNA与预测到的靶基因呈负向调控关系,6个上调miRNA的靶基因下调,1个下调miRNA的靶基因上调,靶基因集中在Wnt、MAPK、P53和cAMP等肿瘤相关信号通路.结论:差异性表达的miRNA包括hsa-miR-27a、hsa-miR-148b、hsa-miR-185、hsa-miR-200a、hsa-miR-200b、hsa-miR-221和hsa-mir-133b,差异性表达的miRNA及其靶基因在CESC的发生发展过程中起重要作用,有可能成为诊断CESC的肿瘤标志物.
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文献信息
篇名 宫颈鳞状细胞癌组织中miRNA差异性表达及其靶基因作为诊断标志物的意义
来源期刊 吉林大学学报(医学版) 学科 医学
关键词 宫颈鳞状细胞癌 微小RNA 肿瘤标志物
年,卷(期) 2016,(1) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 85-88
页数 4页 分类号 R737.33
字数 2969字 语种 中文
DOI 10.13481/j.1671-587x.20160117
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘晓冬 吉林大学公共卫生学院卫生部放射生物学重点实验室 47 173 7.0 10.0
2 马淑梅 吉林大学公共卫生学院卫生部放射生物学重点实验室 24 95 6.0 8.0
3 于飞飞 吉林大学公共卫生学院卫生部放射生物学重点实验室 3 7 2.0 2.0
4 田雨溪 吉林大学公共卫生学院卫生部放射生物学重点实验室 1 4 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
宫颈鳞状细胞癌
微小RNA
肿瘤标志物
研究起点
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相关学者/机构
期刊影响力
吉林大学学报(医学版)
双月刊
1671-587X
22-1342/R
大16开
吉林省长春市新民大街828号
12-23
1959
chi
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