下咽癌中基因功能模块及潜在抗癌药物的筛选

• 作者: 孙娟 孙学威 崔晓波 李玲香 王薇 胡文良
• 来源期刊: 局解手术学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 下咽癌 基因模块 生物信息学 抗癌药物
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 789-792
• 页数: 4页
• 分类号: R739.65
• 字数: 2728字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11659/jjssx.05E016070

摘要

目的：筛选下咽癌中发挥重要作用的基因功能模块和调节这些模块的潜在抗癌药物，为下咽癌的分子治疗提供新靶点。方法利用 GEO 数据库和 MeV 软件筛选下咽癌中差异表达的基因。利用 STRING 数据库，获得差异基因的蛋白质互作网络关系，然后利用 Cystoscape 软件的 MCODE 插件筛选网络中的基因模块。利用 DAVID 数据库获得基因模块的生物学功能。最后，利用 DrugBank 数据库筛选调控这些模块的药物以筛选潜在的抗下咽癌药物。结果在鼻咽癌基因组中，我们共筛选出差异表达基因1222个（P ＜0．05），蛋白质互作关系219对，互作网络中的基因模块7个（MCODE 分数大于1．5）。功能分析的结果显示5个基因模块参与了肿瘤发生发展相关的重要功能，如血管生成（regulation of angiogenesis）、细胞黏附（cell adhesion）、DNA 代谢（DNA metabolic process）等（P ＜0．05）。药物筛选的结果显示共有50个药物能够调控这5个基因模块。结论共有5个基因模块调控下咽癌，并可能通过调控肿瘤血管生成、细胞黏附等生物学功能来发挥促下咽癌作用。它们的靶向药物可能有潜在的抗癌作用，为下咽癌的分子治疗提供新的靶点。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔晓波	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	50	85	5.0	7.0
2	孙学威	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	22	56	3.0	7.0
3	李玲香	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	70	241	9.0	13.0
4	王薇	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	34	52	4.0	5.0
5	孙娟	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	20	29	4.0	4.0
6	胡文良	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	18	62	4.0	7.0