永久性房颤的转录组分析及miRNA调控网络的建立

• 作者: 刘岩 周建 安向光 张希涛 苏丕雄 顾松 高杰
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 永久性房颤 microRNA mRNA 靶基因 网络调控
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1262-1267
• 页数: 6页
• 分类号: R34
• 字数: 2428字
• 语种: 中文

摘要

目的 探索永久性房颤(pAF)发病相关的关键miRNAs及其调控的靶基因.方法 联合应用表达谱芯片和miRNA芯片分析pAF患者(n=7)和健康成人(n=4)的左房组织,筛选pAF相关差异表达的miRNAs,进行靶基因预测后,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-analysis);利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与交集靶基因的调控网络(miRNA-gene-network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被调控的关键靶基因;采用RT-qPCR方法检验另一组pAF患者(n=5)和健康成人(n=4)的左房组织标本.结果 表达谱基因芯片发现610个mRNA有显著性改变(fold change＞2,P＜0.05),miRNA-靶基因调节网络发现与pAF显著相关的20个miRNAs和107个靶基因,相关度最高的是miR-144、niR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p和miR-101;其调控的重要靶基因包括CACNB2、EFNB1、PTEN、TAOK1、RUNX1和TPM3等;RT-qPCR验证结果显示这些miRNAs和靶基因密切相关.结论 通过表达谱基因芯片与miRNAs芯片联合分析pAF左房组织标本,构建miRNA调控网络,发现pAF重要的miRNA-靶基因调控及功能,结果更加准确.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	安向光	首都医科大学附属北京朝阳医院心外科	21	64	5.0	6.0
2	苏丕雄	首都医科大学附属北京朝阳医院心外科	76	268	8.0	13.0
3	刘岩	首都医科大学附属北京朝阳医院心外科	72	237	9.0	11.0
4	张希涛	首都医科大学附属北京朝阳医院心外科	41	137	7.0	10.0
5	顾松	首都医科大学附属北京朝阳医院心外科	69	203	8.0	10.0
6	高杰	首都医科大学附属北京朝阳医院心外科	36	133	6.0	10.0
7	周建	首都医科大学附属北京朝阳医院心外科	9	10	2.0	3.0