梨遗传连锁图谱的构建与比较分析

• 作者: 李疆 李秀根 王磊 王龙 薛华柏
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 梨 SSR 连锁图谱 整合图谱
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 2353-2367
• 页数: 15页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2016.12.011

摘要

【目的】利用已公开发表的梨和苹果的SSR（Simple Sequence Repeat）引物以及从梨转录组开发的SSR引物构建本研究作图群体的遗传连锁图谱，为后期梨重要性状QTL定位和分子标记辅助选择等奠定基础。【方法】以西洋梨品种‘红茄’（Red Clapp Favorite）为母本，东方梨品种‘晚秀’（Mansoo）为父本，构建F1代作图群体。将所选用的SSR引物在亲本和4个子代个体进行PCR扩增，初步筛选出扩增结果符合JoinMap 4.0软件中“CP”作图模式要求的引物，随后在F1群体中检测，选用JoinMap 4.0软件对分离数据进行连锁分析，分别构建亲本的连锁图谱。以双亲图谱在各连锁群上的同源标记作为锚定位点，对双亲图谱进行整合。【结果】利用PCR技术对不同来源的共909对SSR引物（526对梨和283对苹果公开发表的SSR引物，从梨转录组开发的100对SSR引物）进行初步筛选后，发现来自苹果的SSR引物有效扩增片段的比例和多态性均较低，而来自梨和梨转录组开发的SSR引物相对较高。筛选出207对符合作图要求的SSR引物在群体中扩增，构建亲本的连锁图谱。母本图谱中的141个标记分布在17个连锁群上，总长度757.34 cM，标记间平均5.37 cM；父本图谱中的153个标记分布在19个连锁群上，总长度1149.43 cM，标记间平均7.51 cM。【结论】对不同来源的SSR引物构建的双亲连锁图谱进行整合，最终得到一张由186个SSR标记，覆盖基因组长度1125.33 cM的整合图谱。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李秀根	中国农业科学院郑州果树研究所	111	927	17.0	27.0
2	王磊	新疆农业大学林学与园艺学院	49	385	12.0	18.0
6	李疆	新疆农业大学林学与园艺学院	209	2704	28.0	40.0
7	薛华柏	中国农业科学院郑州果树研究所	46	195	9.0	13.0
8	王龙	中国农业科学院郑州果树研究所	60	234	8.0	13.0