类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析

• 作者: 刘辉 孙一丁 曾千春 李程鹏 杨奕 王炎炎 许明辉 马继琼
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 亚洲栽培稻 野生稻 OsHMA2-like基因 进化
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 2009-2015
• 页数: 7页
• 分类号: S511
• 字数: 2771字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2016.09.001

摘要

OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsH-MA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域.对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码区序列进行了测序分析,以了解水稻OsHMA2-like序列的多样性,为发掘基因资源提供信息.OsHMA2-like核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,在471 bp的编码序列内发现了6个变异位点;Tajima's D检验表明均不显著,说明这些位点属中性进化状态;6个变异位点中,第15、78、132、214、417位点碱基不引起氨基酸的变异,而第457位的变异使得5个供试材料(1个0.ni-vara,4个ARO品种和1个粳稻品种)由于提前形成终止子在C末端少3个氨基酸,ARO类品种在此位点上与TRJ、IND、TEJ存在显著差异,这暗示ARO类品种可能由O.nivara演化而来.