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摘要:
[目的]构建细菌性条斑病菌诱导下的水稻抗病均一化差减cDNA文库,对获得的差异表达ESTs进行生物信息学及抗病相关基因的表达分析.[方法]以水稻IR26 (Tester)和两优培九(Driver)幼苗5~6叶期叶片为材料,采用双链特异性核酸酶(DSN)介导的均一化消减杂交技术,构建细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻抗病相关基因差减cDNA文库,以pLB-F和pLB-R为引物,通过菌液PER扩增对差减文库的质量进行检测.[结果] cDNA文库的插入片段分布在0.5~2.0 kb,平均大小约为1.0 kb,重组率达95%.序列测定分析发现,随机挑取的504个克隆中有98条差异表达基因;经BLAST比对和GO注释发现,59条序列具有同源基因,分别参与信号转导、能量代谢、过敏性坏死反应、防卫反应等;另外39条序列无相似基因,有待进一步研究.通过实时荧光定量PCR发现,从该文库中分离得到的OsNDPK4参与细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻防卫反应.[结论]水稻受细菌性条斑病菌侵染的cDNA文库质量较好,为研究条斑病菌致病性因子与水稻互作机制奠定基础.
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文献信息
篇名 细菌性条斑病菌JH01诱导水稻抗病均一化差减文库的构建
来源期刊 安徽农业科学 学科 农学
关键词 细菌性条斑病 水稻 双链特异性核酸酶(DSN) 均一化差减杂交 荧光定量PCR
年,卷(期) 2016,(2) 所属期刊栏目 生物技术
研究方向 页码范围 188-191
页数 4页 分类号 S432.1
字数 3610字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 凌丹燕 浙江师范大学化学与生命科学学院 6 17 3.0 3.0
2 路梅 浙江师范大学化学与生命科学学院 24 137 6.0 10.0
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细菌性条斑病
水稻
双链特异性核酸酶(DSN)
均一化差减杂交
荧光定量PCR
研究起点
研究来源
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相关学者/机构
期刊影响力
安徽农业科学
半月刊
0517-6611
34-1076/S
大16开
安徽省合肥市农科南路40号
26-20
1961
chi
出版文献量(篇)
78281
总下载数(次)
236
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436536
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