重瓣百合LiSEP3基因克隆与表达分析

• 作者: 义鸣放 何俊娜 吴泽 曹兴 李晓昕 杨秋燕 隋娟娟
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 百合 MADS-box家族 基因克隆 表达分析 LiSEP3基因
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 42-48
• 分类号: S682|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2017.01.007

摘要

[目的]克隆百合LiSEP3基因并确定其在百合不同地上器官及不同花瓣中的表达差异,探讨SEP3基因在重瓣花中的表达模式.[方法]利用RACE方法从重瓣百合品种‘比罗尼卡’中克隆得到LiSEP3基因核苷酸序列,利用SMART软件对其蛋白结构进行分析,以MEGA 5.0软件进行系统进化树分析,用基因枪轰击法进行亚细胞定位分析,采用荧光定量PCR进行不同地上器官及不同花瓣中LiSEP3基因表达差异分析.[结果]LiSEP3基因属于MADS-box家族E类基因,其开放阅读框为729 bp,共编码242个氨基酸;LiSEP3基因编码的蛋白具有典型的MADS结构域、K-box区及2个SEP基序;LiSEP3与同为单子叶植物的六出花的SEP3亲缘关系最近;LiSEP3蛋白定位于细胞核中;LiSEP3基因在花中的相对表达量最高,在茎、叶中几无表达;在1～7轮花瓣中均能检测到LiSEP3表达,且位于最内侧的第7轮花瓣中相对表达量最高.[结论]LiSEP3基因属于MADS-box家族E类基因,主要在花中表达,其中在最内侧花瓣中表达量最高,其表达模式与双子叶植物花中SEP3基因表达模式存在不同.