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鸭坦布苏病毒分离鉴定及全基因组序列分析
鸭坦布苏病毒分离鉴定及全基因组序列分析
作者:
倪欣涛
刘芹防
李泽君
李雪松
杨健美
滕巧泱
王宾宾
闫大为
陈鸿军
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鸭坦布苏病毒
分离鉴定
全基因组序列测定
进化树
摘要:
本文采集2015年浙江省2个鸭养殖场中疑似鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)感染的雌麻鸭卵巢病料,经组织研磨处理,DF-1细胞纯化,成功分离了2株鸭坦布苏病毒(DTMUV),分别命名为ZJ201501和ZJ201504.利用9对两两相互重叠的PCR引物,对这2株病毒的全基因进行分段PCR扩增,经序列测定和拼接,得到病毒的全基因组序列.核苷酸序列和E蛋白氨基酸序列比对分析发现:ZJ201501和ZJ201504的核苷酸同源性高达99.9%,全长氨基酸仅有2个位点差异;与选取的19株DTMUV参考序列相比,在核苷酸水平和E蛋白氨基酸水平上,其同源性分别大于97.1%和98.4%,而ZJ201501和ZJ201504与早期分离的DTMUV FX2010遗传距离最远,这表明DTMUV在鸭群中发生了一定的变异.本研究为进一步了解DTMUV的遗传进化提供了理论依据.
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文献信息
篇名
鸭坦布苏病毒分离鉴定及全基因组序列分析
来源期刊
中国动物传染病学报
学科
农学
关键词
鸭坦布苏病毒
分离鉴定
全基因组序列测定
进化树
年,卷(期)
2017,(6)
所属期刊栏目
病毒
研究方向
页码范围
8-14
页数
7页
分类号
S852.659.6
字数
4574字
语种
中文
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分离鉴定
全基因组序列测定
进化树
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国动物传染病学报
主办单位:
中国农业科学院上海兽医研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-6422
CN:
31-2031/S
开本:
大16开
出版地:
上海市闵行区紫月路518号
邮发代号:
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
2151
总下载数(次)
1
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