扶桑绵粉蚧转录组分析

• 作者: 刘善海 周佳滨 孟翔 李润钊 杨陆兴 胡俊杰
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 扶桑绵粉蚧 转录组 基因注释 GO数据库 编码序列 性信息素
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 9-17
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

[目的]建立扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的转录组数据库,揭示扶桑绵粉蚧转录组的整体表达特征.[方法]采用Illumina HiSeqTM 4000测序平台开展对扶桑绵粉蚧雌成虫转录组测定,对原始数据进行过滤和组装.[结果]共获得58 322 258条序列读取片段(reads),共9.48 Gb(GenBank登录号:SAMN06130426)57 422 032条有效转录组数据.进一步组装拼接后,共获得94 475个单基因簇(unigene),平均长度为700 bp.将unigene与数据库中的序列进行BLASTX比对,成功注释20 949个unigenes,其中,Nr注释的unigenes与豌豆蚜Acyrthosiphon pisum unigenes同源性最高,达18.69％.扶桑绵粉蚧转录组unigenes根据GO功能注释大致可分为细胞组分、分子功能和生物过程三大类55个分支,与结合活性、催化活性、细胞进程和代谢进程相关的unigenes较多.此外,本研究还筛选到20条与脂类代谢相关的途径和与性信息素代谢相关的序列.并通过与Nr和Swiss-prot蛋白质数据库比对,获得了15 037条编码序列(CDS)片段.[结论]本研究初步阐明扶桑绵粉蚧雌成虫转录组的整体表达模式,为进一步研究扶桑绵粉蚧的基因功能及性信息素的代谢途径奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡俊杰	广州大学生命科学学院	7	35	3.0	5.0
2	孟翔		1	12	1.0	1.0
3	周佳滨	广州大学生命科学学院	1	12	1.0	1.0
4	杨陆兴	广州大学生命科学学院	1	12	1.0	1.0
5	刘善海	广州大学生命科学学院	1	12	1.0	1.0
6	李润钊	广州大学生命科学学院	1	12	1.0	1.0