神经干细胞与神经元差异表达基因的生物信息学分析

• 作者: 刘友 刘希光 李世安 李爱民
• 来源期刊: 临床神经外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 神经干细胞 生物信息学 基因 肿瘤
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 神经生物学研究
• 页码范围: 406-412,416
• 页数: 8页
• 分类号: R741.05
• 字数: 3755字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-7770.2017.06.002

摘要

目的 通过生物信息学技术探讨神经干细胞与神经元间基因表达的差异,找出关键的差异基因及其潜在的分子调控机制;并对其所涉及的功能进行分析预测.方法 从GEO表达谱数据库中下载与神经干细胞及神经元相关的表达谱基因芯片数据系列GSE70171,导入基因芯片在线分析工具morpheus,筛选出神经干细胞和神经元之间表达差异的基因,并构建聚类分析热图.采用DAVID数据库进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,并使用STRING分析与Cytoscape软件构建PPI网络.结果 筛选出表达差异的基因有4022个,其中神经干细胞比神经元上调的基因有2146个,下调基因1876个.对表达差异的基因进行的生物信息学分析发现,下调的基因主要与神经元功能相关,上调基因与神经干细胞细胞再生和有肿瘤特征相关,其中神经干细胞的细胞周期通路和癌症通路存在研究价值.结论 神经干细胞与神经元之间存在表达差异基因.几个关键基因CDC6、CDKN2A、CDC14A、BUB1、TTK、CHEK1、CDC25C在细胞周期通路中可能与神经干细胞再生功能相关.而KIF23、CDKN2A、TNC、CDC25C、CDCA5、BRCA1可能与神经干细胞的肿瘤特征相关.然而,这些关键基因的功能还需要今后的实验研究进一步证实.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李爱民	徐州医科大学附属连云港医院神经外科	25	18	2.0	2.0
2	刘希光	徐州医科大学附属连云港医院神经外科	11	16	2.0	2.0
3	李世安	徐州医科大学附属连云港医院神经外科	2	4	1.0	2.0
4	刘友	徐州医科大学附属连云港医院神经外科	2	3	1.0	1.0