华南植物园锥栗F￣MSAP采样策略及遗传多样性分析

• 作者: 全慧敏 刘卫 刘孟 叶万辉 欧阳学军 陈洁
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 锥栗 甲基化 F￣MSAP 引物筛选 样品保存
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传多样性专栏
• 页码范围: 15-21,8
• 页数: 8页
• 分类号: Q943
• 字数: 5507字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201603024

摘要

基因组甲基化修饰受环境因素的影响。在以甲基化为代表的表观遗传学研究中,如何减少保存环境对异地采后样品的影响,提高整个实验的准确性和科学性,目前尚未有系统的认知。该研究选取5种常用的采后样品保存方式(液氮冷冻、－20℃冷冻、变色硅胶干燥、密封袋密封、75％酒精浸泡),分别用 Wilcoxon signed ranks tests统计分析和UPGMA聚类分析方法,对华南植物园锥栗进行F￣MSAP 研究,以期找出最佳保存方式。同时,利用正交试验法对F￣MSAP 体系进行优化,筛选出9对引物( E3￣H/M2；E5￣H/M2；E6￣H/M1；E6￣H/M5；E8￣H/M1；E8￣H/M5；E9￣H/M2；E11￣H/M5；E14￣H/M1),并对不同发育时期的锥栗甲基化水平及遗传多样性进行了论述。结果表明：在锥栗F￣MSAP 的研究中,Willcoxon signed ranks tests统计分析和UPGMA聚类分析结论一致,密封袋保存效果最佳；成熟叶半甲基化率(27.83％)和总甲基化率(51.13％)高于幼叶(21.35％,45.90％),全甲基化率(23.30％)低于幼叶(24.55％),平均多态位点百分数39.60％,香农信息指数0.207±0.002,表现出较高的甲基化水平和遗传多样性。