华南沿海长鳍篮子鱼不同地理群体的遗传多样性分析

• 作者: 彭敏 肖珊 洪传远 潘传燕 冯鹏霏 李旻 曾地刚 杨春玲 蒋伟明 陈秀荔
• 来源期刊: 水生态学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 长鳍篮子鱼 遗传多样性 地理群体 线粒体控制区 华南沿海
• 年，卷（期）: 2022,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 127-133
• 页数: 6页
• 分类号: Q347
• 语种: 中文
• DOI: 10.15928/j.1674-3075.202104280127

摘要

为探明华南沿海长鳍篮子鱼(Siganus canaliculatus)不同地理群体遗传多样性与遗传分化状况，采用线粒体控制区（D-loop）基因序列分析华南沿海的厦门(XM)、汕尾(SW)、阳江(YJ)、海口(HK)、三亚(SY)、北海(BH)、钦州(QZ)、防城港(FC)以及越南清化(TH)共9个地理位置的长鳍篮子鱼群体的遗传多样性及群体遗传结构。结果显示，长鳍篮子鱼群体DNA D-loop 序列共计484条，序列长度约828 bp，包含57个变异位点，92个单倍型；所有群体总的单倍型多样性指数(Hd)为0.80798，核苷酸多样性指数(π)为0.00405；群体内遗传距离为0.00386~0.00532，群体间遗传距离为0.00383~0.00482，群体间分化指数为0.01935~0.00759，各种分组的AMOVA分析均显示遗传变异全部来自群体内；Fu's Fs检验值为显著负值(-25.53678，P<0.01)，核苷酸错配分布图呈单峰，吻合度检验数值较小且不显著，提示长鳍篮子鱼可能经历过种群扩张事件，推测扩张时间在1.18万~4.74万年。研究表明，南海北部沿岸及东海南部9个长鳍篮子鱼地理群体间不存在显著的地理结构和谱系结构，可划归一个管理单元进行种质资源保护。