拟南芥蛋白质丰度与基因翻译效率关联分析

• 作者: 张琳 王娟 王曦光
• 来源期刊: 中国生物工程杂志
• 学科: 体育
• 关键词: 蛋白质丰度 基因表达 CAI ITE 翻译延伸效率 相关分析 拟南芥
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 40-47
• 页数: 8页
• 分类号: G819
• 语种: 中文
• DOI: 10.13523/j.cb.20170207

摘要

蛋白质的合成是一个复杂的过程,其中蛋白质丰度是衡量基因表达的一个最终指标,在生物体生命活动中具有重要作用的蛋白质通常都为高丰度蛋白质.通过对PaxDB网站拟南芥各组织器官蛋白质丰度的统计,并采用DAMBE和CodonW计算其对应基因的ITE和CAI值,最后用R语言分析蛋白质丰度与ITE的关系,并采用对数值替代原有的丰度值.结果表明,所使用的ITE较原有CAI的分析方法更有效,在拟南芥的基因中高表达基因在不同的组织中有相似的表达水平,拟南芥蛋白质丰度与ITE有很好的相关性,并且ITE值能更好地拟合拟南芥蛋白质丰度值的变化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张琳	中国农业科学院农业资源与农业区划研究所	49	1459	18.0	38.0