2014年广东省登革热大流行的病原体来源及分子进化特点

• 作者: 司露露 吴德 周俊梅 崔国辉 方丹云 晏辉钧 江丽芳 郭前方
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 登革热 登革病毒 E基因 全基因组 系统进化分析 贝叶斯分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 21-28
• 页数: 8页
• 分类号: R377.33
• 字数: 4362字
• 语种: 中文

摘要

【目的】分离培养与鉴定2014年广东省登革热暴发流行的病原体，从分子进化方向分析其来源和遗传进化特点，为登革热的监测和防控提供科学依据。【方法】在2014年登革热暴发流行期间，采集广东省不同地区登革热患者的血清标本，从中分离培养登革病毒并进行型别鉴定。采用RT-PCR和测序技术获取病毒的E基因和全基因组序列，并对其进行系统进化分析、贝叶斯进化分析和遗传变异分析。【结果】分离培养与鉴定了40株登革病毒1型（DENV-1）病毒，获得了这40株分离株的完整E基因序列和其中6株分离株的全基因组序列。E基因进化分析结果显示，40株分离株中有16株为基因Ⅰ型，24株为基因Ⅴ型。16株基因Ⅰ型毒株中有14株与2013年广州市和2013年新加坡流行的毒株高度同源，核苷酸相似度为99.6%~99.9%，另2株基因Ⅰ型毒株则与2013年马来西亚流行的毒株亲缘关系最近，核苷酸相似度为99.7%。24株基因Ⅴ型毒株均与2009年孟加拉、广州市和2013年不丹流行的毒株同源性高，核苷酸相似度为99.0%~99.9%。对6株病毒全基因组进化分析结果显示，其中5株病毒与2013年广州市和中山市流行的毒株高度同源，核苷酸相似度为99.6%~99.8%，另一株病毒则与2002年的缅甸流行株亲缘关系最近，核苷酸相似度为98.8%。对E基因的遗传变异分析结果显示，与2013年广东省的流行代表株比较，2014年广东省分离株有5个氨基酸位点发生了变异，其中3个（S88V，E203G，T275R）位于EⅡ区的毒力位点区域，1个（S305P）位于EⅢ区的毒力位点区域。【结论】2014年广东省登革热的病原体主要为DENV-1，且至少有2种基因型同时在流行；其可能来源于2013年广东省流行的毒株，也可能来源于新加坡、马来西亚、缅甸等东南亚国家的毒株，其中2013年广东省流行的毒株可能是重要来源之一，提示须加强对本地毒株及传播媒介的监测和研究，以便了解登革热是否在广东省本地化的问题；在流行过程中，病毒有些氨基酸位点已发生变异，其中有4个变异位点位于登革病毒的毒力位点区域，提示有必要对这些变异的生物学意义开展进一步研究。