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水曲柳FmABI5基因非生物胁迫及信号诱导的表达模式分析
水曲柳FmABI5基因非生物胁迫及信号诱导的表达模式分析
作者:
于磊
刘春浩
刘颖
孙爽
梁楠松
覃俊祺
詹亚光
赵兴堂
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水曲柳
FmABI5
生物信息学分析
非生物胁迫
摘要:
ABI5(abscisic acid-insensitive 5)蛋白是一个响应ABA信号的碱性亮氨酸拉链类(basic leucine zipper,bZIP)转录因子.揭示了水曲柳FmABI5在非生物胁迫下的表达特征,为该基因在水曲柳中代谢调控功能的研究奠定基础.获得了水曲柳ABI5基因的全长,命名为FmABI5,应用生物信息学软件分析了水曲柳FmABI5基因的分子结构特征,利用PEG、低温(4℃)及盐(Nacl)进行非生物胁迫处理,利用脱落酸(ABA)和赤霉素(GA3)进行信号诱导,分析FmABI5的表达特征.生物信息学分析表明该基因全长1 455 bp,含有完整的开放阅读框,编码484个氨基酸.FmABI5为不稳定类亲水性蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,α-螺旋、延伸链、无规则卷曲分布于整个蛋白.分子进化分析结果表明,水曲柳FmABI5基因与芝麻的遗传距离较近,说明其亲缘关系较近.;与马铃薯、潘那利番茄、水茄与甜椒的遗传距离较远,说明其亲缘关系较远.非生物胁迫结果表明,FmABI5基因表达水平随非生物胁迫处理时间不同而上下波动,但在处理6、48和72 h后,FmABI5基因对3种非生物胁迫处理都上调表达,说明FmABI5基因对非生物胁迫具有响应.信号诱导结果表明,外源的ABA与GA共同调节了FmABI5基因的表达.
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水曲柳
FmPAL
生物信息学分析
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内容分析
文献信息
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
水曲柳FmABI5基因非生物胁迫及信号诱导的表达模式分析
来源期刊
植物研究
学科
生物学
关键词
水曲柳
FmABI5
生物信息学分析
非生物胁迫
年,卷(期)
2017,(3)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
453-460
页数
8页
分类号
Q949.776.2
字数
4594字
语种
中文
DOI
10.7525/j.issn.1673-5102.2017.03.017
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(73)
参考文献
(40)
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引证文献
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研究主题发展历程
节点文献
水曲柳
FmABI5
生物信息学分析
非生物胁迫
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物研究
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1673-5102
CN:
23-1480/S
开本:
大16开
出版地:
哈尔滨市和兴路26号东北林业大学
邮发代号:
14-77
创刊时间:
1959
语种:
chi
出版文献量(篇)
2736
总下载数(次)
1
总被引数(次)
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