CTCF通过ALAS2调控K562细胞红系分化

• 作者: 亓合媛 张昭军 方向东 李艳明 熊倩 谢兵兵
• 来源期刊: 发育医学电子杂志
• 关键词: CTCF ALAS2 GATA1 红系分化
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 字数: 3184字
• 语种: 中文

摘要

目的 研究CTCF对红系分化的影响及相应调控机制.方法 敲低K562细胞中的CTCF,通过Hemin诱导和荧光实时定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术,分析Hemin诱导0到4天的对照和CTCF敲低细胞的珠蛋白基因表达水平,研究CTCF敲低对红系分化的影响.利用基因表达芯片全基因组范围分析CTCF敲低造成的影响.根据公共数据分析推测CTCF调控红系分化的潜在机制,通过染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)验证.结果 随着诱导的进行,对照和敲低细胞中的珠蛋白基因HBE和HBG表达均逐渐升高,但CTCF敲低细胞中HBE和HBG基因水平均低于对照细胞,提示CTCF敲低能够抑制K562细胞分化过程中珠蛋白基因的表达.通过检测全基因组范围的基因表达水平,共筛选到1 128个差异表达基因,其中616个基因在CTCF敲低样本中表达上调,512个基因表达下调.利用IPA软件进行功能富集分析,显示主要相关的生理系统发育与功能包括血液系统的发育与功能.公共数据显示存在CTCF-GATA1-ALAS2作用关系,ALAS2基因上存在GATA1结合;对照和CTCF敲低细胞的ChIP-qPCR结果表明,敲低CTCF能够降低GATA1在ALAS2基因区的结合.结论 CTCF可能通过影响GATAI在ALAS2基因区的结合来调控K562细胞红系分化.