K562细胞向红系分化相关EST的鉴别与分析

• 作者: 余佳 张俊武 彭瀚 陈?
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: 差异显示反转录聚合酶链反应 K562细胞 细胞分化 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 150-154
• 页数: 5页
• 分类号: Q784
• 语种: 中文

摘要

目的鉴别并获取与K562细胞向红系分化相关的表达序列标签(expressed sequence tags,EST).方法利用改进的差异显示反转录聚合酶链反应(differential display reverse transcription polymerase chain reaction,DDRT-PCR)方法,分析诱导前及用氯高铁血红素(hemin)诱导36 h后K562细胞的差异表达cDNA片段,挑选其中差异明显的cDNA片段,经克隆、测序和基因信息学分析,挑选代表新序列或有一定功能线索的差异表达EST进行Northern印迹分析.结果获得诱导前后K562细胞的差异表达cDNA片段60条,其中38条表达上调,22条表达下调.对40个差异表达明显的cDNA片段的生物信息学分析说明,23个EST与GenBank中已知序列有95%以上同源性,10个为只与dbEST有高度同源的序列,7个未发现同源序列;进行Northern印迹分析的8个差异表达EST中,6个EST的杂交结果与DDRT-PCR显示的差异表达状况一致.结论改进的DDRT-PCR方法能够较好地克服假阳性问题,这些差异表达EST的获得为进一步研究红系分化的分子机制和控调网络提供了一定线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭瀚		2	1	1.0	1.0
2	张俊武		12	104	5.0	10.0
3	余佳		2	4	1.0	2.0
4	陈?		2	3	1.0	1.0