纳豆芽孢杆菌谷氨酸脱氢酶基因的克隆表达及其生物信息学分析

• 作者: 任媛媛 孟永宏 屈玉玲 张宸 董桂茹 陈卫锋
• 来源期刊: 陕西师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 纳豆芽孢杆菌 谷氨酸脱氢酶 cDNA 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 82-86
• 页数: 5页
• 分类号: TS201.3
• 字数: 4393字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15983/j.cnki.jsnu.2017.01.115

摘要

克隆表达Bacillus subtilis natto HSF 1410谷氨酸脱氢酶(GDH),测定其酶活性,并阐述其体内功能.将gdhA基因克隆入pET28a质粒在E.coli BL21(DE3)中表达,用生物信息学方法探究其蛋白结构、结构域特点.经测定Bacillus subtilis natto GDH同时具有NADP+和NAD+依赖活性,酶活比活力分别为3.140 U/mg蛋白和0.251 4 U/mg蛋白.生物信息学分析结果表明gdhA基因包含一个长度为1 275 bp的开放阅读框,编码424个氨基酸,蛋白分子量为47.05 kDa,理论等电点为5.58,不合跨膜区域,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.其三级结构表明,该蛋白在45-174位氨基酸残基形成二聚化结构域,191-424位氨基酸残基形成NAD(P)结合位域.B.subtilis natto HSF 1410与E.coli中gdhA的二聚化结构域、NAD(P)结合位域的氨基酸相似度分别为29.23％、29.27％,显著高于B.subtilis 168中gdhA的氨基酸相似度;与B.subtilis 168中gdhA蛋白空间结构相比,B.subtilis natto HSF 1410与E.coli中gdhA在空间结构上更为相似,在体内主要负责促α-酮戊二酸转化成谷氨酸.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈卫锋	陕西省科学院酶工程研究所	14	163	6.0	12.0
2	孟永宏	陕西师范大学食品工程与营养科学学院	63	212	8.0	11.0
3	任媛媛	陕西师范大学食品工程与营养科学学院	9	14	2.0	3.0
4	董桂茹	陕西师范大学食品工程与营养科学学院	4	8	2.0	2.0
5	屈玉玲	陕西师范大学食品工程与营养科学学院	3	8	2.0	2.0
6	张宸	陕西师范大学食品工程与营养科学学院	2	3	1.0	1.0