艾纳香脱氢酶基因家族的生物信息学分析

• 作者: 于福来 官玲亮 庞玉新 查英 王凯 白琳 谢小丽 陈松笔
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 艾纳香 艾纳香脱氢酶(BbADH) 氨基酸序列 保守区 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1145-1153
• 页数: 9页
• 分类号: Q78
• 字数: 4478字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.06.011

摘要

采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera(L.)DC.)叶片中克隆到4条编码艾纳香脱氢酶(BbADH1、BbADH2、BbADH3、BbADH4)基因的cDNA序列,并对4条核苷酸及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析.结果显示:4条艾纳香脱氢酶序列开放阅读框均在900 bp左右,蛋白质等电点(pI)值在5.0～9.0之间,含量最多的氨基酸为亮氨酸(Leu),最少的为色氨酸(Try),具有明显的疏水区和亲水区,N端未发现信号肽,且无跨膜区;同源性比对结果显示,艾纳香BbADH蛋白与其他植物中ADH蛋白具有高度的相似性,且具有脱氢酶的特征功能域;系统发育分析表明,艾纳香(B.balsamifera(L.)DC.)BbADH1和BbADH3同处于一个分支,且与胡杨(Populus euphratica Oliv.)PeADH物种亲缘关系较近,而艾纳香BbADH4和BbADH2处于不同分支,且分别与葡萄(Vitis vinifera)VvADH和烟草(Nicotiana tabacum)NtADH物种亲缘关系较近.