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利用基因表达值相对大小秩序标志鉴别肺癌
利用基因表达值相对大小秩序标志鉴别肺癌
作者:
严海丹
关庆洲
朱慧敏
林云轻
郑宝童
郑智军
郭政
陈燕花
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
标志
分类器
肺癌
数据标准化
批次效应
摘要:
在应用基于转录组特征构建的支持向量机、贝叶斯分类器等传统分类器对组织样本进行分类时,要求对基因表达谱进行样本间的数据标准化处理,以去除实验批次效应带来的影响,因此限制了这些分类器在个体化水平上的应用.本文旨在构建鉴别肺癌组织与非癌(肺炎与肺正常)组织的个体化分类器.文中采用来自多组独立数据的197例肺癌与189例肺非癌组织样本作为训练集,筛选得到了3对基因作为特征,应用多数投票规则区分肺癌组织与肺非癌组织的平均准确率达到95.34%.然后,本文采用来自多组独立数据的251例肺癌组织与141例肺非癌组织样本的非标化数据进行独立验证,其平均准确率达到96.78%.因此,本文提出的该分类器可对由不同实验室检测的样本进行个体化判断提供一种新的思路,具有较强的临床实用性.
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文献信息
篇名
利用基因表达值相对大小秩序标志鉴别肺癌
来源期刊
生物医学工程学杂志
学科
关键词
标志
分类器
肺癌
数据标准化
批次效应
年,卷(期)
2017,(1)
所属期刊栏目
新技术与新方法
研究方向
页码范围
129-133
页数
5页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.7507/1001-5515.201608002
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肺癌
数据标准化
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物医学工程学杂志
主办单位:
四川大学华西医院
四川省生物医学工程学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-5515
CN:
51-1258/R
开本:
大16开
出版地:
四川省成都市武候区外南国学巷37号 四川大学华西医院
邮发代号:
62-65
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
5280
总下载数(次)
31
总被引数(次)
37300
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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