伴放线放线杆菌细胞致死性扩张毒素序列进化分析

• 作者: 侯本祥 喻钢 孙静华 张琛
• 来源期刊: 牙体牙髓牙周病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 伴放线放线杆菌 细胞致死性扩张毒素 进化 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 493-498,535
• 页数: 7页
• 分类号: R780.2
• 字数: 3867字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15956/j.cnki.chin.j.conserv.dent.2017.09.001

摘要

目的:应用生物信息学的方法研究伴放线放线杆菌(4a)细胞致死性扩张毒素(CDT)的3个蛋白亚基在不同细菌中的序列变化情况,为牙周病中Aa菌株的检测提供思路.方法:运用ncbigenbank数据库、蛋白同源性比对(blastP和tblastn)及极大似然法构建进化树等,研究Aa中CDT蛋白的3个亚基在不同菌种的序列保守性.结果:在Genbank数据库674个属的细菌中,发现有20个属27个种含有CDT蛋白亚基,其中11个种的细菌只含有CdtB蛋白亚基.在进化过程中,CdtB与CDT其他两种亚基蛋白相比,序列间的变化无明显相关性,且蛋白序列更为保守.系统进化树分析表明,Aa的CdtB蛋白与嗜血杆菌属、沙门氏菌属和螺杆菌属的细菌有较近的亲缘关系.结论:Aa CDT蛋白复合体的CdtB与其他两个亚基的蛋白在序列进化上存在显著差异,推测一些菌种中CDT蛋白毒性功能的发挥并不需要3个亚基共同存在.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯本祥	首都医科大学附属北京口腔医院牙体牙髓科	123	753	14.0	19.0
2	张琛	首都医科大学附属北京口腔医院牙体牙髓科	35	257	10.0	14.0
3	孙静华	首都医科大学附属北京口腔医院牙体牙髓科	3	3	1.0	1.0
4	喻钢		9	3	1.0	1.0