干露胁迫对长牡蛎基因组DNA甲基化的影响

• 作者: 于红 孔令锋 张鑫 李琪
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 长牡蛎 干露胁迫 DNA甲基化 荧光标记甲基化敏感扩增多态性(F-MSAP)
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 690-697
• 页数: 8页
• 分类号: S94
• 字数: 5566字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2017.16238

摘要

为探讨干露胁迫对海产贝类基因组DNA甲基化的影响,应用荧光标记甲基化敏感扩增多态性(fluorescence-labeled methylation sensitive amplified polymorphism,F-MSAP)技术,比较了不同干露条件下(0 d、0.5 d、1 d、3 d、5 d、7 d、9 d和11 d)长牡蛎(Crassostrea gigas)基因组DNA甲基化的变化.结果表明,对照组(干露处理0 d)闭壳肌与鳃组织的总体甲基化水平分别为29.76%和29.82%;干露处理0.5 d、1 d、3 d、5 d、7 d、9 d和11 d的长牡蛎全基因组甲基化水平呈现先增高后降低的趋势,其中,闭壳肌组织的总体甲基化水平分别为36.59%、38.86%、43.02%、39.30%、51.13%、46.79%和35.06%,鳃组织总体甲基化水平分别为39.39%、42.13%、39.36%、43.54%、56.19%、38.57%和28.99%;干露处理7 d的长牡蛎甲基化水平明显高于其他时期(P<0.05),11 d时甲基化水平基本恢复至初始状态.甲基化变异模式分析发现,闭壳肌与鳃组织DNA甲基化变异位点存在差异,甲基化升高位点变化程度较大(P<0.05).以上结果表明,长牡蛎通过改变DNA甲基化模式来应答干露胁迫,发生了不同程度的甲基化与去甲基化反应,DNA甲基化与长牡蛎的抗逆性状密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李琪	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	152	1522	20.0	31.0
2	孔令锋	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	79	808	16.0	24.0
3	张鑫	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	35	297	10.0	16.0
4	于红	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	49	498	12.0	20.0