人前列腺LRIG1蛋白三维结构同源模建及其小分子激动剂的虚拟筛选

• 作者: 周文龙 崔仁杰 张朝晖 杨安卿 楚晨龙 赵晨晖 马斌斌 黄滔
• 来源期刊: 医学分子生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: LRIG1 前列腺肿瘤 虚拟筛选
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 280-286
• 页数: 7页
• 分类号: R34
• 字数: 5072字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-8009.2017.05.000

摘要

目的 LRIG1(tandem leucine-rich repeat sand immunoglobulin-like domains 1,LRIG1)是新近发现的抑癌基因,在前列腺癌中表达下降,通过对人前列腺LRIG1蛋白的三维结构进行同源模建,虚拟筛选出LRIG1的功能蛋白,试图为前列腺癌新靶点治疗提供新思路.方法 以LRIG1的同源蛋白LRRC4 C蛋白的晶体结构(PDB号3 ZYJ)为模型,通过MODELLER软件搭建LRIG1蛋白的三维空间结构;采用柔性对接的虚拟筛选技术,以荷兰SPECS公司的202490个化合物进行对接和打分,挑选出排名靠前的10个小分子化合物;通过AMBER软件分别进行20 ns的分子动力学模拟,并分析这10个小分子的结合模式、 动力学轨迹的RMSD、RMSF、 结合口袋的氢键以及它们的结合能量.结果 10个小分子化合物都具有一致的结合模式,而且都具有激活LRIG1活性的潜在能力.结论 发现与人LRIG1具有潜在特异结合能力的激动剂,可以为前列腺癌治疗新靶点的确立及开发具有药理活性的先导化合物提供理论依据.