嵌合抗CD20抗体Fab'片段三维结构的同源模建

• 作者: 彭晖 朱祯平 杨纯正 熊冬生 范冬梅 赖增祖 郑梦杰
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 同源模建 CD20 抗体Fab'片段
• 年，卷（期）: 2001,（12）
• 所属期刊栏目: 研究通讯
• 页码范围: 4-8
• 页数: 5页
• 分类号: Q5
• 字数: 4487字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2001.12.002

摘要

分别以抗CD20Fab'轻链和Fd段的氨基酸一级序列为探针,在PDB数据库中搜寻与其同源性高的蛋白作为参考蛋白,利用Insight II/MSI的同源蛋白质结构模建系统(homology) 在SGI计算机图形工作站上模建轻链和Fd段的三维空间结构后,搭建成抗CD20嵌合抗体片段F ab'的空间构象,并对模建蛋白进行分子力学和分子动力学优化.对优化后的模建蛋白的合理性验证显示,模建蛋白的三维结构是合理而可信的.