四种重要医学媒介蚊虫离子受体基因IR8a和IR25a的特征及分类地位

• 作者: 何正波 梅婷 王婷婷 郝友进 陈斌
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蚊虫 iGluRs IRs IR8a IR25a 全基因组鉴定 序列特征 系统发育
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 379-388
• 页数: 10页
• 分类号: Q966
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2017.04.003

摘要

[目的]鉴定中华按蚊Anopheles sinensis、冈比亚按蚊Anopheles gambiae、埃及伊蚊Aedes aegypti和致倦库蚊Culex quinquefasciatus 4种重要医学媒介蚊虫的离子受体基因IR8a与IR25a以及代表性的iGluRs基因和IRs基因,研究这些基因的特征及其系统发育关系,确定IR8a与IR25a基因在离子谷氨酸受体基因中的分类地位.[方法]以黑腹果蝇Drosophila melanogaster的iGluRs和IRs基因序列作为询问序列,用BLASTP和BLASTN方法分别搜索中华按蚊、冈比亚按蚊、埃及伊蚊和致倦库蚊的基因组数据库,以鉴定这4个种内的iGluRs和IRs基因序列;用生物信息学方法比较分析鉴定获得的IR8a与IR25a及代表性的iGluRs和IRs基因氨基酸序列的特征;用最大似然法、贝叶斯法和最大简约法构建并讨论这些基因氨基酸序列的系统发育关系;用PAML软件计算这些基因的dN/ds (ω)值并分析其选择压力.[结果]通过对中华按蚊、冈比亚按蚊、埃及伊蚊和致倦库蚊中离子谷氨酸受体基因进行生物信息学鉴定,获得了所有IR8a和IR25a基因,24个代表性的iGluRs基因和30个代表性的IRs基因的序列.特征比较和系统发育关系分析结果表明,在4种蚊虫和黑腹果蝇中IR8a与IR25a基因的氨基酸序列长度与iGluRs的更接近,其平均值远大于其他IRs的;IR25a和IR8a有与传统iGluRs相同的氨基酸末端区域(amino-terminal domain,ATD),虽然IR8a的序列不太保守,而IRs则没有ATD;IR8a与IR25a序列有与传统iGluRs一样保守的配体结合区S1和S2,而IRs没有.所有这些基因的ω值远小于1,意味着这些基因在进化过程中都经历了纯化选择,而IR8a与IR25a的ω值更接近iGluRs.此外,IR8a与IR25a还有与non-NMDA相似的特异性位点,而这些位点在IRs不存在.再者,IR8a和IR25a与non-NMDA聚在一枝,形成一个姐妹群,群内序列间的遗传距离小于本研究中任何其他序列间的距离.根据这些研究结果,我们将IR8a与IR25a分类进入传统iGluRs中的non-NMDA类型,并命名为Putative受体.[讨论]本研究构建了蚊虫iGluRs和IRs基因的信息框架,确定了IR8a与IR25a基因的分类地位,对进一步的功能研究具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈斌	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	73	290	9.0	15.0
2	郝友进	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	19	52	5.0	6.0
3	何正波	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	26	180	8.0	13.0
4	王婷婷	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	4	1	1.0	1.0
5	梅婷	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	2	6	1.0	2.0